
由細(xì)菌或真菌通過自身代謝合成的天然多肽化合物,例如青霉素、環(huán)孢素、棘白霉素類化合物等,許多都具有抗菌或抗腫瘤活性,是國內(nèi)外新藥創(chuàng)制的重要源泉。它們的生物合成途徑分為兩類,一類通過核糖體來源的多肽進(jìn)行縮合、修飾及環(huán)合,另一類則通過一種具有高度模塊化特征的非核糖體多肽合酶(NRPS)將天然或非天然的氨基酸逐一組裝起來,這種工作機(jī)制兼具高效性和靈活的特異性,保證了天然多肽產(chǎn)物結(jié)構(gòu)的多樣性。對細(xì)菌和真菌非核糖體多肽合酶的組裝、結(jié)構(gòu)和催化機(jī)制研究,有助于深入了解天然多肽化合物的生物合成機(jī)制,并使通過組合生物合成手段獲得更多有生物活性的多肽化合物成為可能。
早期的研究表明:細(xì)菌來源的NRPS途徑鏈狀多肽產(chǎn)物的釋放與環(huán)合是通過硫酯酶(thioesterase, TE)完成的,而真菌NRPS則經(jīng)常由一個(gè)類似于縮合結(jié)合域的功能域(CT功能域)來控制多肽產(chǎn)物生物合成的終止與環(huán)合。為了從分子機(jī)制上闡明CT功能域如何在控制真菌NRPS生物合成終止過程中發(fā)揮作用,中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所生命有機(jī)化學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的周佳海研究團(tuán)隊(duì)分別解析了CT功能域(1.8埃分辨率)和處于活化狀態(tài)的T-CT復(fù)合物(2.49埃分辨率)的晶體結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)經(jīng)典縮合結(jié)構(gòu)域的一段N端環(huán)狀區(qū)域被CT功能域相應(yīng)的α1螺旋所取代,并導(dǎo)致α2螺旋向活性口袋鄰近的接納位點(diǎn)靠近(見下圖1.),從而阻滯了與T功能域相連的底物上載到接納位點(diǎn)上進(jìn)行新一輪的肽基延伸反應(yīng)。

T-CT復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)揭示一旦T功能域被活化后,磷酸泛酰巰基將參與穩(wěn)定T與CT的相互作用,并從CT功能域活性口袋的一側(cè)接納線狀多肽產(chǎn)物,完成最終環(huán)狀多肽產(chǎn)物的合成與釋放。這不僅解釋了真菌NRPS中CT功能域?yàn)楹伪仨氁蕾嘥功能域才發(fā)揮作用,也為通過合理設(shè)計(jì)來產(chǎn)生不同大小與結(jié)構(gòu)的新型大環(huán)多肽天然產(chǎn)物提供了技術(shù)藍(lán)圖。
該課題研究是與美國加州大學(xué)洛杉磯分校的Yi Tang教授和中國科學(xué)院武漢數(shù)學(xué)物理研究所的唐淳研究員合作完成的,得到了國家自然科學(xué)基金委面上項(xiàng)目和上海市科委項(xiàng)目的資助,晶體衍射數(shù)據(jù)是分別在國家蛋白質(zhì)科學(xué)(上海)研究中心的BL19U1、上海光源的BL17U1及日本光工廠的BL5a 線站收集的。主要成果已于2016年10月18日由國際知名期刊Nature Chemical Biology上在線發(fā)表,上海有機(jī)化學(xué)研究所生命有機(jī)化學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室周佳海研究員課題組的張金儒博士是本文的第一作者。
附DOI鏈接:http://www.nature.com/nchembio/journal/vaop/ncurrent/full/nchembio.2202.html
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