在1997年香港回歸祖國之際，為發(fā)揮兩地優(yōu)勢組合的能力，促進滬港兩地化學界的交流，提高兩地的化學合成競爭力，由上海有機所戴立信院士、陸熙炎院士、林國強院士、香港中文大學黃乃正院士、麥松威院士、香港大學支志明院士共同發(fā)起，上海有機所和香港中文大學、香港大學共同組建了滬港化學合成聯合實驗室。于1999年1月14日在上海有機所正式成立。迄今上海有機所與香港數所大學的科研合作和交流有20多年的歷史。
在滬港兩地科學家共同努力下，聯合實驗室已經成為少數優(yōu)秀類中國科學院與香港組建的聯合實驗室之一。自科學院于2004年首次對所有科學院-香港共建的聯合實驗室進行評估至今，已連續(xù)4次評估獲優(yōu)秀。
滬港聯合實驗室主要以基礎研究為主，同時注重學科交叉以及香港、內地的合作研究。學科方向包括在具有生命科學研究意義的分子以及其他重要天然產物的合成及化學；高效、高選擇性、環(huán)境友好的合成方法的研究；過渡金屬催化反應方法學及機理；金屬絡合物的結構化學和催化；碳硼烷化學；有趣有用的稠環(huán)芳香化合物的設計、合成與自組裝；高性能有機半導體材料與器件；多肽分子庫及其藥物化學等領域。實驗室是獨立研究實體平臺，擁有專門的科研隊伍，可招收研究生。學術隊伍中包含院士3名、國家杰出青年基金獲得者2名、優(yōu)青/海青、國家高層次青年人才等17名。課題組近期研究工作在Nature、J. Am. Chem. Soc.、Angew. Chem. Int. Ed.、Nat. Chem.均有發(fā)表。
聯合實驗室成立至今，已有50多名研究生獲得博士學位，20多名研究生獲得碩士學位，其中1名研究生獲得中國科學院院長特別獎。聯合實驗室將每年定期選派學生赴港學習交流并進行相關課題研究；組織學生參加全港研究生化學學術年會及內地學生暑期研究體驗計劃；多次參與組織香港大學、香港中文大學等國際學術活動。促進了兩地研究生的學術及文化交流。
滬港聯合實驗室吸引中國優(yōu)秀的年輕學子及研究生投身于化學合成事業(yè)。并以此為平臺，促進與國際化學界之間的交流。
